MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp6

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021228	TTTA	2	8	45	52	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021228	TAAAT	2	10	144	153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021228	A	6	6	161	166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021228	AT	3	6	187	192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021228	AT	3	6	302	307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021228	TATT	2	8	333	340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021228	T	6	6	356	361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021228	A	6	6	390	395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021228	TAA	3	9	409	417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021228	T	6	6	442	447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021228	ACA	2	6	528	533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021228	T	8	8	596	603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021228	CTG	2	6	608	613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021228	T	7	7	619	625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021228	CAA	2	6	682	687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021228	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021228	GAAT	2	8	704	711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021228	A	7	7	743	749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021228	ATA	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021228	A	6	6	864	869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021228	A	8	8	884	891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021228	T	6	6	946	951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021228	A	6	6	962	967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021228	AT	4	8	993	1000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021228	TTA	2	6	1016	1021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021228	CCT	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021228	ATT	2	6	3422	3427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021228	AC	3	6	3442	3447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021228	ATT	2	6	3505	3510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021228	A	6	6	3518	3523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021228	TA	3	6	3557	3562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021228	AATA	2	8	3665	3672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021228	ATC	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021228	A	6	6	4322	4327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021228	TAA	2	6	4328	4333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021228	T	6	6	4970	4975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021228	GTT	2	6	4977	4982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021228	CTA	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021228	TGG	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021228	TCATT	2	10	5119	5128	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021228	A	6	6	5144	5149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021228	TAAC	2	8	5329	5336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021228	TTTAA	2	10	5351	5360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021228	AAT	2	6	5367	5372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021228	TTTTG	2	10	5621	5630	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021228	CTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021228	TTA	2	6	5711	5716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021228	A	6	6	5869	5874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021228	AACG	2	8	5952	5959	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021228	GTG	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021228	TA	3	6	6067	6072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021228	ACT	2	6	6258	6263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021228	AATT	2	8	6281	6288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021228	AGG	2	6	6299	6304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021228	A	6	6	7766	7771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021228	AGA	2	6	7776	7781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021228	ATT	2	6	7860	7865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021228	TGG	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021228	A	6	6	7908	7913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021228	TTA	2	6	8594	8599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021228	TTAT	2	8	8648	8655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.